MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium pseudotuberculosis I19 chromosome

Total Repeats: 37866

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017303	AAG	2	6	38	43	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507789
2	NC_017303	GCT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507789
3	NC_017303	A	6	6	187	192	100 %	0 %	0 %	0 %	384507789
4	NC_017303	TTA	2	6	330	335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384507789
5	NC_017303	CAA	2	6	400	405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384507789
6	NC_017303	AT	3	6	412	417	50 %	50 %	0 %	0 %	384507789
7	NC_017303	CTT	2	6	458	463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507789
8	NC_017303	TCA	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507789
9	NC_017303	CA	3	6	610	615	50 %	0 %	0 %	50 %	384507789
10	NC_017303	TGC	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507789
11	NC_017303	G	6	6	661	666	0 %	0 %	100 %	0 %	384507789
12	NC_017303	TTCC	2	8	710	717	0 %	50 %	0 %	50 %	384507789
13	NC_017303	CGC	2	6	722	727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384507789
14	NC_017303	AGC	2	6	737	742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507789
15	NC_017303	CAG	2	6	833	838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507789
16	NC_017303	AGCC	2	8	857	864	25 %	0 %	25 %	50 %	384507789
17	NC_017303	ATGC	2	8	922	929	25 %	25 %	25 %	25 %	384507789
18	NC_017303	AT	3	6	1005	1010	50 %	50 %	0 %	0 %	384507789
19	NC_017303	CAGG	2	8	1029	1036	25 %	0 %	50 %	25 %	384507789
20	NC_017303	GAT	2	6	1081	1086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507789
21	NC_017303	TCC	2	6	1094	1099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384507789
22	NC_017303	AAG	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507789
23	NC_017303	GAA	2	6	1120	1125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507789
24	NC_017303	T	6	6	1126	1131	0 %	100 %	0 %	0 %	384507789
25	NC_017303	TACG	2	8	1223	1230	25 %	25 %	25 %	25 %	384507789
26	NC_017303	TGA	2	6	1295	1300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507789
27	NC_017303	GGC	2	6	1305	1310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384507789
28	NC_017303	TTG	2	6	1322	1327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384507789
29	NC_017303	ATG	2	6	1489	1494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507789
30	NC_017303	GATG	2	8	1560	1567	25 %	25 %	50 %	0 %	384507789
31	NC_017303	CG	3	6	1611	1616	0 %	0 %	50 %	50 %	384507789
32	NC_017303	ACCAC	2	10	1694	1703	40 %	0 %	0 %	60 %	384507789
33	NC_017303	GAA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507789
34	NC_017303	ATG	2	6	1760	1765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507789
35	NC_017303	GCT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507789
36	NC_017303	GCA	2	6	1782	1787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507789
37	NC_017303	TTC	2	6	1797	1802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507789
38	NC_017303	TAAA	2	8	1829	1836	75 %	25 %	0 %	0 %	384507790
39	NC_017303	AGT	2	6	1905	1910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507790
40	NC_017303	GAAG	2	8	2429	2436	50 %	0 %	50 %	0 %	384507791
41	NC_017303	CCCA	2	8	2484	2491	25 %	0 %	0 %	75 %	384507791
42	NC_017303	TAC	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507791
43	NC_017303	TCA	2	6	2512	2517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507791
44	NC_017303	GAT	2	6	2523	2528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507791
45	NC_017303	GCT	2	6	2627	2632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507791
46	NC_017303	CAT	2	6	2639	2644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507791
47	NC_017303	CTGC	2	8	2769	2776	0 %	25 %	25 %	50 %	384507791
48	NC_017303	GCA	3	9	2829	2837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507791
49	NC_017303	TC	3	6	3005	3010	0 %	50 %	0 %	50 %	384507791
50	NC_017303	GCT	2	6	3170	3175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507791
51	NC_017303	GAAA	2	8	3255	3262	75 %	0 %	25 %	0 %	384507791
52	NC_017303	CGG	2	6	3307	3312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384507791
53	NC_017303	AGA	2	6	3335	3340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507791
54	NC_017303	TTAC	2	8	3398	3405	25 %	50 %	0 %	25 %	384507791
55	NC_017303	GAG	2	6	3492	3497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384507791
56	NC_017303	TCGT	2	8	3683	3690	0 %	50 %	25 %	25 %	384507792
57	NC_017303	TTG	2	6	3766	3771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384507792
58	NC_017303	AT	3	6	3782	3787	50 %	50 %	0 %	0 %	384507792
59	NC_017303	CTG	2	6	3868	3873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507792
60	NC_017303	GTG	2	6	4027	4032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507792
61	NC_017303	TTG	2	6	4066	4071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384507792
62	NC_017303	GAT	2	6	4185	4190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507792
63	NC_017303	GAG	2	6	4389	4394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384507792
64	NC_017303	CGT	2	6	4396	4401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507792
65	NC_017303	A	6	6	4463	4468	100 %	0 %	0 %	0 %	384507792
66	NC_017303	GAC	2	6	4509	4514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507792
67	NC_017303	CGA	2	6	4649	4654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507792
68	NC_017303	AAGG	2	8	4839	4846	50 %	0 %	50 %	0 %	384507792
69	NC_017303	CTG	2	6	4868	4873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507793
70	NC_017303	AGA	2	6	4884	4889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507793
71	NC_017303	TGC	2	6	4908	4913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507793
72	NC_017303	GCG	2	6	4932	4937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384507793
73	NC_017303	TC	3	6	4956	4961	0 %	50 %	0 %	50 %	384507793
74	NC_017303	A	6	6	5024	5029	100 %	0 %	0 %	0 %	384507793
75	NC_017303	ACG	2	6	5075	5080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507793
76	NC_017303	CGG	2	6	5145	5150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384507793
77	NC_017303	TGG	2	6	5177	5182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507793
78	NC_017303	A	6	6	5186	5191	100 %	0 %	0 %	0 %	384507793
79	NC_017303	AGC	2	6	5193	5198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507793
80	NC_017303	AC	3	6	5199	5204	50 %	0 %	0 %	50 %	384507793
81	NC_017303	ATG	2	6	5278	5283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507793
82	NC_017303	ATAC	2	8	5414	5421	50 %	25 %	0 %	25 %	384507793
83	NC_017303	CACGC	2	10	5735	5744	20 %	0 %	20 %	60 %	384507794
84	NC_017303	CGG	2	6	5770	5775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384507794
85	NC_017303	ATGC	2	8	5816	5823	25 %	25 %	25 %	25 %	384507794
86	NC_017303	TGG	2	6	5869	5874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507794
87	NC_017303	GGT	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507794
88	NC_017303	ACC	2	6	6059	6064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384507794
89	NC_017303	ACC	3	9	6098	6106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384507794
90	NC_017303	CAT	2	6	6118	6123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507794
91	NC_017303	TCG	2	6	6127	6132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507794
92	NC_017303	GAA	2	6	6200	6205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507794
93	NC_017303	TGA	2	6	6226	6231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507794
94	NC_017303	A	6	6	6261	6266	100 %	0 %	0 %	0 %	384507794
95	NC_017303	CCGATG	2	12	6273	6284	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384507794
96	NC_017303	CTG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507794
97	NC_017303	GAA	2	6	6310	6315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507794
98	NC_017303	GAA	2	6	6322	6327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507794
99	NC_017303	TTA	2	6	6337	6342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384507794
100	NC_017303	TGA	2	6	6430	6435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507794
101	NC_017303	GAA	2	6	6533	6538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507794
102	NC_017303	TGA	2	6	6564	6569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507794
103	NC_017303	CG	3	6	6577	6582	0 %	0 %	50 %	50 %	384507794
104	NC_017303	AAAGAA	2	12	6599	6610	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384507794
105	NC_017303	TCT	2	6	6818	6823	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507794
106	NC_017303	GGC	2	6	6838	6843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384507794
107	NC_017303	TGG	2	6	6889	6894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507794
108	NC_017303	GGT	2	6	6974	6979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507794
109	NC_017303	ATT	2	6	7097	7102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384507794
110	NC_017303	ATG	2	6	7125	7130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507794
111	NC_017303	CAA	2	6	7141	7146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384507794
112	NC_017303	GCT	3	9	7210	7218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507794
113	NC_017303	TTG	2	6	7223	7228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384507794
114	NC_017303	CCG	2	6	7280	7285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384507794
115	NC_017303	GAA	2	6	7358	7363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507794
116	NC_017303	CAA	2	6	7387	7392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384507794
117	NC_017303	GAT	2	6	7394	7399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507794
118	NC_017303	ATG	2	6	7500	7505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507794
119	NC_017303	TGA	2	6	7516	7521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507794
120	NC_017303	TCG	2	6	7558	7563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507794
121	NC_017303	T	6	6	7804	7809	0 %	100 %	0 %	0 %	384507795
122	NC_017303	TTC	2	6	7898	7903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507795
123	NC_017303	GAG	2	6	7946	7951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384507795
124	NC_017303	AGC	2	6	7958	7963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507795
125	NC_017303	TGC	2	6	7994	7999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507795
126	NC_017303	GAG	2	6	8105	8110	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384507795
127	NC_017303	AT	3	6	8127	8132	50 %	50 %	0 %	0 %	384507795
128	NC_017303	ATT	2	6	8303	8308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384507796
129	NC_017303	GAAA	2	8	8470	8477	75 %	0 %	25 %	0 %	384507797
130	NC_017303	CTG	2	6	8547	8552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507797
131	NC_017303	GGA	2	6	8571	8576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384507797
132	NC_017303	TGT	2	6	8592	8597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384507797
133	NC_017303	CTG	2	6	8600	8605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507797
134	NC_017303	TGC	2	6	8651	8656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507797
135	NC_017303	GTC	2	6	8661	8666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507797
136	NC_017303	GCG	2	6	8723	8728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384507798
137	NC_017303	TGA	2	6	8809	8814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507798
138	NC_017303	GCT	2	6	8826	8831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507798
139	NC_017303	CGA	2	6	9087	9092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507799
140	NC_017303	GCG	2	6	9101	9106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384507799
141	NC_017303	GAG	2	6	9142	9147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384507799
142	NC_017303	CCG	2	6	9234	9239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384507799
143	NC_017303	ACG	2	6	9440	9445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507799
144	NC_017303	CGC	2	6	9450	9455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384507799
145	NC_017303	ACTC	2	8	9477	9484	25 %	25 %	0 %	50 %	384507799
146	NC_017303	TTC	2	6	9572	9577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507799
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148	NC_017303	TGA	2	6	9599	9604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507799
149	NC_017303	CAAC	2	8	9635	9642	50 %	0 %	0 %	50 %	384507799
150	NC_017303	TCT	2	6	9680	9685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507799
151	NC_017303	GCAT	2	8	9730	9737	25 %	25 %	25 %	25 %	384507799
152	NC_017303	GAA	2	6	9859	9864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507799
153	NC_017303	CG	3	6	10046	10051	0 %	0 %	50 %	50 %	384507799
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156	NC_017303	TCG	2	6	10197	10202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507799
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160	NC_017303	AGA	2	6	10421	10426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507799
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164	NC_017303	GAA	2	6	10594	10599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507799
165	NC_017303	GTG	3	9	10621	10629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507799
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167	NC_017303	CTT	2	6	10746	10751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507799
168	NC_017303	CACG	2	8	10761	10768	25 %	0 %	25 %	50 %	384507799
169	NC_017303	CG	4	8	10845	10852	0 %	0 %	50 %	50 %	384507799
170	NC_017303	AAG	2	6	10972	10977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507799
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173	NC_017303	ATG	2	6	11075	11080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507799
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245	NC_017303	AAAG	2	8	15051	15058	75 %	0 %	25 %	0 %	384507804
246	NC_017303	GCA	2	6	15064	15069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507804
247	NC_017303	GAA	2	6	15145	15150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507804
248	NC_017303	CT	3	6	15206	15211	0 %	50 %	0 %	50 %	384507804
249	NC_017303	AAG	2	6	15242	15247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507804
250	NC_017303	AGCT	2	8	15350	15357	25 %	25 %	25 %	25 %	384507804
251	NC_017303	TAG	2	6	15389	15394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384507804
252	NC_017303	A	6	6	15426	15431	100 %	0 %	0 %	0 %	384507804
253	NC_017303	CAGTG	2	10	15503	15512	20 %	20 %	40 %	20 %	384507804
254	NC_017303	TTG	2	6	15629	15634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384507804
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257	NC_017303	ATT	2	6	15687	15692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384507804
258	NC_017303	GCA	3	9	15714	15722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507805
259	NC_017303	CCA	2	6	15745	15750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384507805
260	NC_017303	CGA	2	6	15755	15760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507805
261	NC_017303	CGG	2	6	15771	15776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384507805
262	NC_017303	CGT	2	6	15865	15870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507805
263	NC_017303	TCG	2	6	15925	15930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507805
264	NC_017303	TAC	2	6	15992	15997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384507805
265	NC_017303	CGA	2	6	16012	16017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507805
266	NC_017303	TTTA	2	8	16067	16074	25 %	75 %	0 %	0 %	384507805
267	NC_017303	TGC	2	6	16162	16167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507805
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269	NC_017303	T	6	6	16309	16314	0 %	100 %	0 %	0 %	384507805
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274	NC_017303	TAT	2	6	16553	16558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384507805
275	NC_017303	CGC	2	6	16559	16564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384507805
276	NC_017303	CGG	2	6	16571	16576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384507805
277	NC_017303	TGC	2	6	16708	16713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507805
278	NC_017303	AAAAT	2	10	16763	16772	80 %	20 %	0 %	0 %	384507805
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286	NC_017303	GGT	2	6	17229	17234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384507806
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300	NC_017303	GAA	2	6	17706	17711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507807
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369	NC_017303	GTT	2	6	22057	22062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384507816
370	NC_017303	TACC	2	8	22258	22265	25 %	25 %	0 %	50 %	384507817
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374	NC_017303	CCA	2	6	22740	22745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384507818
375	NC_017303	TC	3	6	22815	22820	0 %	50 %	0 %	50 %	384507818
376	NC_017303	CGA	2	6	22835	22840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384507818
377	NC_017303	CAA	2	6	22860	22865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384507818
378	NC_017303	AGA	2	6	22887	22892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384507818
379	NC_017303	TTC	2	6	22894	22899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384507818
380	NC_017303	TGC	2	6	22977	22982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384507818
381	NC_017303	TCC	2	6	23033	23038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384507818
382	NC_017303	AGCG	2	8	23049	23056	25 %	0 %	50 %	25 %	384507818
383	NC_017303	T	6	6	23154	23159	0 %	100 %	0 %	0 %	384507818
384	NC_017303	TGGAT	2	10	23217	23226	20 %	40 %	40 %	0 %	384507818
385	NC_017303	TTGA	2	8	23238	23245	25 %	50 %	25 %	0 %	384507818
386	NC_017303	TTGTCT	2	12	23312	23323	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384507818
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